Das Höhlenkundliche Museum befindet sich im Erdgeschoß des Eingangs zur Laichinger Tiefenhöhle. Diese ist die einzige Schachthöhle in Deutschland, die als Schauhöhle zugänglich ist. Mit 90 m Tiefe und 1.372 m Gesamtlänge zählt sie zu den bedeutendsten Karstobjekten der Schwäbischen Alb.
Das Höhlenkundliche Museum bietet Hintergrundinformationen zur Geologie von Karstgebieten, zur Entstehung von Höhlen, zu archäologischen und paläontologischen Funden, Höhlensedimenten, Höhlenmineralien und sogar zur Höhlenforschung. Neu ist eine Multimediainstallation zur Höhlenforschung im Blauhöhlensystem. Hier wurde von mehreren Gruppen von Höhlenforschen etwas 20 Kilometer eines weitverzweigten Höhlensystems erforscht, das die mittlere Schwäbische Alb nach Blaubeuren zum Blautopf entwässert.